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分享 专家称:方舟子对分子生物已一窍不通
岳东晓 2016-8-6 08:52
看到有网友说想指出方舟子在韩氏NgAgo 评论中的错误,但怕遭到打击报复,我建议大家把信息发给我,我来发布。现在我根据收到的信息做一个综合简评。 首先看方舟子对韩春雨论文中的几个电泳图提出的质疑。方舟子认为这些电泳图是韩春雨造假的铁证。据方舟子说,韩氏电泳图上条条在运动方向中间落后、两侧超出,不可能,肯定造假,而且是低级的PS。对此,有方舟子“超级粉丝” 非常诚恳地向他指出,在分子较小时这个现象经常发生,并不见得是造假。这条信息方舟子登在了新语丝网站上了,应该算是承认了这个可能。 网上搜索电泳图,类似的情况经常出现。大家可以去查查。确实,电泳是一个复杂边界条件的麦克斯韦尔方程与动力学方程解,图形结果没有铁律。仅凭狭隘的经验来判断是不行的。 再看这张 JesseCai 的分析图: http://image.sciencenet.cn/home/201607/16/160051u2pvrb6rrpsz2zb2.jpg JesseCai 的分析是 : 图 4a 中 G6与 G13 5'p尾部相差30nt,而电泳图看不出两者的差别,在 4.e Cas9 与 NgAgo 的比较中,切割点相距应该小于 13 nt , 电泳图却存在明显的位置差异。换言之,其疑问是 13 nt 的差别在 4.e 都显示出来了,为何30 nt 的差别 4.a 没看出来。 方舟子对 JesseCai 的 理解: 专家评论:凝胶电泳只是粗略地估计分子量大小,这种电泳条带的小幅位移,往往是由于样品成分如盐分,DNA纯度,蛋白质等造成的阻滞效应,根本不足以判断真正的分子量大小,只有通过测序才能确证。 岳某评论:从图看,250到500, 500到750尺度间距变小。两幅图比例不同,而电泳带接近500,光看电泳带的宽度就已经超过对比带的间距,两者存在重叠,即便是假定电泳带位置仅与分子量有关,恐怕也无法断言有 30 nt 的resolution。
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分享 轮回 (小小说) - 读岳东晓iMan关于温度的辩论有感
热度 5 大音希声 2014-7-10 15:23
上个星期二岳东晓不幸得了心脏病,被送进医院抢救无效,仙逝了,但马上就转世成了一只羊。 从天上咕咚一声落在羊圈里的时候,宜修正好在给iMan喂草料。 iMan被这咕咚一声下了一大跳,回头一看,先是惊讶,马上把羊角立了起来。 哎呀,是岳东晓呵,怎么你也转世成羊了?啪地一头就撞了过去。 岳东晓一看是 iMan就笑了起来,嘿,你转的那个傻蛋文,一窍不通,把我心 脏 病都气出来了。 你中专水平连温度都搞不明白,你有脑子吗?简直就是羊脑子。 iMan说,你说我是羊脑子,还用微积分来证明,你是在算馒头体积嘛?一看就是唬人的。 这回可好,你也成羊了。 宜修赶紧拿出手机来打电话给铜山,说, 铜山 你 是信教的,赶快祈祷一下上帝, 岳东晓和 iMan怎么都轮回到一个羊圈里了? 铜山说,咳,别提了,我每天在祈祷上帝,牧羊犬牧羊犬,现在我刚刚 轮回成了牧羊犬,一会儿见吧。 宜修很郁闷,心想,要是 岳东晓 轮回成一只母羊,也许 iMan会爱上她,那这个世界该多好啊。
12085 次阅读|40 个评论
分享 科普游泳池水温--傻蛋为何蠢得做猪叫
热度 3 岳东晓 2014-7-10 06:01
前言: 刚看了iMan转帖的傻蛋文,纯粹抄袭网络,但对搜索结果却一窍不通,他智商明显低于iMan。 iMan对我的相关物理陈述没有提出质疑,说明他比傻蛋有脑子,在我点拨之后,他应该感觉到这其中有道理,于是把话题转向其他的方面,也就是人对水温的感觉, 不断提问,而不敢进行陈述,避免了被打回原形。 而傻蛋则把那鸡蛋脑袋主动伸出主动充当了金箍棒下的试验品。湖南有句俗话,蠢得做猪叫。这个形容傻蛋非常形象,你蠢点要是不做声,其实别人不知道,蠢得做猪叫,就是说蠢而且像猪一样的叫唤,让人家都知道其蠢。 。为了打这出头蠢猪现原形,下面我就游泳池水温度变化 与人对温度的感觉做一个科普。 首先,有一个前提必须明确,整个讨论是针对猫眼前些天的写晚上游泳的感觉,背景是南加州的夏天,而且是白天烈日当空后的夜晚。离开了这个背景,就是在脱离主题,没有意义了。比如说,我提到下午四点,当然是指南加州夏天的下午四点,而不是南极洲。 我在前面评论中提到,游泳池的水温取决于其能量的收支情况,能量来源最最主要的是太阳能,其他均可忽略,关键问题是失去能量的机制,我认为这个失去能量的机制主要是phase transition,对于水来说,当然就是蒸发。水在进行这个由液体到气体的phase transition时,需要大量的能量,这是小学生都应该知道的。 这里我就相关的物理过程稍微分析一下,说明我判断的数学基础,算是提供一个指南。 设游泳池水体积为V,水密度为 \rho ,水温为T,水比热为 C ,游泳池面积为A, 气温为 T_a ,单位时间吸收能量为 J_{in} , 单位时间失去能量为 J_{out} ,池水的温度变化dT满足 V\rho C dT = dt 温度的变化计算取决于右边对时间的积分。 J_{in} 的贡献包括(1)太阳能;(2)空气的热传导;(3)空气的热辐射;(4)水池底及墙的热辐射;等等。但在白天,我们可以简单忽略(2)--(4)。 太阳能的能量流密度S约为1.3千瓦每平方米(垂直照射时),设太阳光与游泳池法向的夹角为 \theta , 则 J_{in} = e AS \cos\theta 。 其中e是吸收太阳光的效率,简单来说就是入射光能量减去反射光能量的比例,估计池水反射的阳光约为20%,因此e约为80%。 注意上面这个角度是随时间变化的,对上述式子积分即可得出太阳贡献随时间的变化,直到太阳西下,这个贡献是递增的。但水池也同时在失去能量,失去的总能量也随时间递增。什么时候水温最高? \frac{dT}{dt} =0 的时候,也就是当 J_{in}=J_{out} ---吸收的太阳能量流等于失去能量流的时候。相关角度公式为 \theta=\cos^{-1}\frac{J_{out}}{eAS} 。我估计是下午四点,当然,这是个估计,具体计算等我有时间再做。 至于为什么水池失去能量的最主要机制是蒸发(相变)? 具体计算我也只能等我有时间之后再做,但从估计的角度这是一个显然的事情。人体温度跟游泳池水温接近,都是约为300K,如果皮肤干燥,气温稍低也不会觉得冷,而如果皮肤是湿的,气温略低,就明显感觉冷。可见,水的相变带走的热量远大于其他因素。其次失去能量因素,我认为应该是人体的红外辐射。空气传导可能是最次要的。 值得注意的是,空气虽然也对水辐射,但其能量密度应该非常小,因为空气密度很小。你考虑一下红外线在空气中的吸收度,经过time reversal,就应该可以看出,空气辐射很小。但水本身的辐射则应该解近黑体辐射。相关的物理,要真搞明白得懂量子统计,等我有时间再科普。 上面提到人的冷热感觉,其实是人对热量失去速度的感觉。所谓温度计是基于有一个物理值是温度的函数,那么其反函数就可以确定温度了。 比如说水银柱的长度,热敏电阻的电阻等。人体内并不存在一个温度计器官。 而人体感觉的冷热是失去热量的速度,这不但取决于外界物体的温度,还取决于外界物体的其他物理素性,因此,人根本无法进行温度的判断。所以,你的神经系统可以让你在90度的桑拿浴中呆在15分钟,但不能忍受90度的热水烫。类似的吗,同样零摄氏度的塑料与铁块,后者会感觉很冷,而前者似乎相对暖和。 人跳入水中是否感觉温暖需要计算的是人体的热量散失速度(并与入水前热量散失速度比较),而不是水的温度。
个人分类: 科普|12970 次阅读|8 个评论
分享 国歌和缘分
热度 7 卉樱果 2013-2-7 13:53
我这人浏览博客,习惯不看作者只看内容,因此也忘记是谁写的有关国歌的文字了,只记得有提到美国国歌。 偶一向孤陋寡闻,第一次看到美国国歌的介绍,很感兴趣,因为孙子即将居住加拿大,我早已有心给他唱加拿大国歌了。又由于孙子是美国籍,因此刚才又去you tube找了下美国国歌的录音,做了书签,顺便也想熟悉下旋律和歌词。 听了好几遍,没有感觉,再去寻找独唱、合唱,也没有感觉。学不会。。。。。。。。 因此想到,喜欢一首歌,不管是国歌还是民歌还是摇滚还是古典还是流行歌曲,都是要有缘分的。 对加拿大国歌就不一样,第一次听见就爱上了她。 那是刚移民到加拿大第一年,在华埠警讯中心做义工,八月的一个晚上,参加数个华人侨团赞助组织的千人耆英(每桌20人,共50桌)宴席义工,地点在华埠富 大酒家。我分到的工作是将老人引到其餐桌。主持人说粤语,我一窍不通。只见她说了句什么,大堂里响起一阵悠扬的乐声,只见那些坐轮椅的、撑拐杖的老人颤颤 巍巍地站了起来,千位耆英开始唱了起来。 我马上意识到:这是加拿大的国歌!她悠扬而又神圣,大气而又平和。我听不清歌词,但脑海中立刻出现远古壮观的班夫冰川,源远流长的奥肯纳根湖泊,飞机上俯瞰到的嵌在大平洋大西洋中的东部西部岛屿,觉得加拿大国歌的旋律一如她的地貌那样宽阔自在。 回到家,我马上下载了加拿大国歌,就着歌词学起来。至今为止,在温哥华老人(英语)合唱团滥竽充数了几年,加拿大国歌是我极少数无需看歌谱歌词能一个人唱的歌曲之一。 而今天听着美国的国歌,对于旋律找不到任何感动的感觉,对于歌词也不喜欢她的硝烟味,因此也失去了学唱和教唱孙子的兴趣。 就像每次到美国旅游,虽然她在加拿大的隔壁,我就觉得这是外国。第一次去美国是1987年,那时的中国还在萌动的”原始“社会。美国给我的印象是眼花缭乱 的繁华和先进。后来移民加拿大后又旅游了美国东部、中部和西部,唯一喜欢的就是夏威夷。在加拿大旅游就不同,即便第一次去东部的海洋省,也会有爱的感觉有 为她骄傲的感觉。 最后说说中国国歌吧。小时候说实话我并不喜欢她的旋律,与我酷爱的各民族的民歌差的太远了,旋律过于短促,还不如少年先锋队队歌好听呢。再加上50年代的 收音机音响效果很差,播音员说话听来也像京剧老生那么沙哑。再说,我对于聂耳、洗星海的乐曲全部都是敬而远之的。唯有两次,我惊讶地发现国歌可以演奏的那 么好听的。一次是1966年国庆 到上海人民广场看焰火,交响乐队现场演奏国歌,在各种西洋乐器的混合声中,我第一次感到我们的国歌还是蛮有感染力的。还有一次是1969年十七岁那年 (16岁就做工了, 童工哦)与几个女友去同事家,她家有一架钢琴。我们竭力要求她弹一曲,她略微思索了一下,就弹了国歌。我是第一次与钢琴近距离接触,觉得她弹的国歌真好听 呀。 后来,一直到现在,我每次听到中国国歌,总是觉得六十多年来,国歌的歌词一如既往地表达着老百姓的心愿。这也是缘分吧。 附上加拿大国歌(维基) O Canada! Our home and native land! True patriot love, in all thy sons command. With glowing hearts we see thee rise, The True North strong and free! From far and wide,O Canada, We stand on guard for thee. God keep our land, glorious and free! O Canada, we stand on guard for thee. O Canada, we stand on guard for thee. 啊,加拿大,吾家园吾故土! 爱国真心,统领您众儿女。 心怀赤诚,看您崛起, 真北之邦自由强壮! 无远弗届,啊,加拿大, 我们为您站着岗。 神佑我土,自由荣光! 啊,加拿大,我们为您站着岗。 啊,加拿大,我们为您站着岗。 ****************************** 砸砖的献花的,都请欣赏下 加拿大国歌 吧 请 点 击 画 廊 -求加分
个人分类: 加国文化|7434 次阅读|15 个评论

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